Protein–RNA interactions for Protein: O95096

NKX2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-2O95096 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NKX2-2O95096 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKX2-2O95096 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-2O95096 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms