Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC42.13■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC42.08■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
SOGA1O94964 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
SOGA1O94964 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SOGA1O94964 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SOGA1O94964 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
SOGA1O94964 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SOGA1O94964 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SOGA1O94964 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
SOGA1O94964 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
SOGA1O94964 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
SOGA1O94964 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
SOGA1O94964 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SOGA1O94964 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
SOGA1O94964 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SOGA1O94964 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SOGA1O94964 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SOGA1O94964 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SOGA1O94964 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SOGA1O94964 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC42■■■■■ 4.31
SOGA1O94964 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
SOGA1O94964 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC41.99■■■■■ 4.31
SOGA1O94964 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
SOGA1O94964 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SOGA1O94964 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SOGA1O94964 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
SOGA1O94964 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
SOGA1O94964 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
SOGA1O94964 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
SOGA1O94964 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
SOGA1O94964 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
SOGA1O94964 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC41.96■■■■■ 4.31
SOGA1O94964 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SOGA1O94964 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
SOGA1O94964 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
SOGA1O94964 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SOGA1O94964 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC41.91■■■■■ 4.3
SOGA1O94964 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SOGA1O94964 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SOGA1O94964 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
SOGA1O94964 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SOGA1O94964 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SOGA1O94964 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SOGA1O94964 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SOGA1O94964 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SOGA1O94964 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SOGA1O94964 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SOGA1O94964 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SOGA1O94964 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.3
SOGA1O94964 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
SOGA1O94964 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms