Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DCTN3O75935 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DCTN3O75935 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms