Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 CAST-210ENST00000484552 1767 ntTSL 1 (best)7.71□□□□□ -1.181e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 CLIP1-205ENST00000514271 3493 ntTSL 27.7□□□□□ -1.181e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.181e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 TTC12-206ENST00000462711 535 ntTSL 37.66□□□□□ -1.181e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.21e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 CAST-232ENST00000510500 1835 ntTSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.211e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.231e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.231e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.251e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 TCF12-224ENST00000561346 852 ntTSL 27.15□□□□□ -1.261e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 TCF12-220ENST00000560887 540 ntTSL 47.15□□□□□ -1.261e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 SOX6-204ENST00000524650 534 ntTSL 47.13□□□□□ -1.271e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 ZNF780B-205ENST00000595995 393 ntTSL 56.89□□□□□ -1.311e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 LINC00969-308ENST00000628547 882 ntTSL 56.79□□□□□ -1.321e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 LINC00969-250ENST00000615493 712 ntTSL 56.73□□□□□ -1.331e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.351e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.371e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 KIF1B-208ENST00000483340 839 ntTSL 26.5□□□□□ -1.371e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 TCF12-211ENST00000559216 475 ntTSL 46.35□□□□□ -1.391e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 LINC00969-335ENST00000631105 702 ntTSL 56.33□□□□□ -1.41e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 EPB41L2-202ENST00000368126 715 ntTSL 26.31□□□□□ -1.41e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 WDR41-228ENST00000515321 585 ntTSL 46.25□□□□□ -1.412e-20■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 WDR41-222ENST00000513417 577 ntTSL 46.25□□□□□ -1.412e-20■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 ZNF766-207ENST00000600016 572 ntTSL 46.08□□□□□ -1.441e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 ATG7-212ENST00000446110 435 ntTSL 36.01□□□□□ -1.451e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.451e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PTPN2-214ENST00000592059 577 ntTSL 45.91□□□□□ -1.461e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 WDR41-214ENST00000509858 461 ntTSL 35.85□□□□□ -1.472e-20■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.471e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 ROCK2-204ENST00000431087 729 ntTSL 35.83□□□□□ -1.481e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.481e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.491e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 TRIM52-202ENST00000510796 633 ntTSL 25.67□□□□□ -1.51e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 WDR41-227ENST00000515253 1507 ntTSL 25.33□□□□□ -1.562e-20■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 KIF1B-206ENST00000465635 759 ntTSL 35.21□□□□□ -1.581e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 WDR41-209ENST00000507239 616 ntTSL 25.13□□□□□ -1.592e-20■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 WDR41-225ENST00000514559 570 ntTSL 45.13□□□□□ -1.592e-20■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 CAST-209ENST00000437034 3377 ntTSL 1 (best)5.01□□□□□ -1.611e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 INTS6-212ENST00000485178 474 ntTSL 54.77□□□□□ -1.651e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.681e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.681e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PACRGL-205ENST00000471979 1394 ntTSL 24.29□□□□□ -1.721e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 WDR41-211ENST00000507654 562 ntTSL 54.28□□□□□ -1.722e-20■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 WDR41-216ENST00000509971 543 ntTSL 34.05□□□□□ -1.762e-20■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 WDR41-215ENST00000509892 611 ntTSL 53.99□□□□□ -1.772e-20■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PTPN2-211ENST00000591305 876 ntTSL 33.82□□□□□ -1.81e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 ZNF577-211ENST00000638875 459 ntTSL 33.59□□□□□ -1.831e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 CAST-229ENST00000510098 1323 ntTSL 1 (best)3.37□□□□□ -1.871e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 ZNF766-204ENST00000595000 559 ntTSL 43.26□□□□□ -1.891e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 NSA2-204ENST00000515524 448 ntTSL 23.11□□□□□ -1.911e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 WDR7-210ENST00000591449 522 ntTSL 43□□□□□ -1.931e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 NEBL-201ENST00000377119 1599 ntTSL 52.94□□□□□ -1.941e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.941e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 ICE1-203ENST00000512608 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 42.48□□□□□ -2.011e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 CAST-226ENST00000509529 3066 ntTSL 22.44□□□□□ -2.021e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 WDR41-223ENST00000513917 596 ntTSL 42.42□□□□□ -2.022e-20■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 LMNTD2-203ENST00000469990 1232 ntTSL 1 (best)29.21■■■□□ 2.271e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 DPH1-213ENST00000575667 1644 ntTSL 1 (best)25.67■■□□□ 1.71e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.481e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 DPH1-211ENST00000572819 1345 ntTSL 523.57■■□□□ 1.361e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.351e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 DPH1-206ENST00000571418 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 223.46■■□□□ 1.351e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.231e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.221e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 NFKB2-205ENST00000467116 1634 ntTSL 221.87■■□□□ 1.091e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.991e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.941e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 DPH1-215ENST00000576129 991 ntTSL 220.82■□□□□ 0.921e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.871e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.861e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.841e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.841e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.812e-16■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.81e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 RABAC1-204ENST00000598057 662 nt19.99■□□□□ 0.792e-16■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.771e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.772e-16■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.752e-16■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 POMT2-214ENST00000556326 948 ntTSL 1 (best)19.59■□□□□ 0.731e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 RABAC1-202ENST00000595226 725 ntTSL 219.38■□□□□ 0.692e-16■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 RABAC1-206ENST00000600292 653 ntTSL 219.19■□□□□ 0.662e-16■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.571e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.531e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.511e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.461e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 POMT2-202ENST00000452340 5647 ntTSL 217.88■□□□□ 0.451e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 RABAC1-207ENST00000601028 530 ntTSL 216.98■□□□□ 0.312e-16■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.271e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 ARHGEF40-203ENST00000554514 2928 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.151e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 ACSL4-212ENST00000514500 696 ntTSL 515.69■□□□□ 0.11e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.081e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 ARHGEF40-202ENST00000553709 5204 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.061e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.051e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 ARHGEF40-207ENST00000556399 4902 ntTSL 1 (best)15.1■□□□□ 0.011e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.041e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 DPH1-204ENST00000570833 558 ntTSL 513.92□□□□□ -0.181e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.181e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.211e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 ARHGEF40-206ENST00000555232 3902 ntTSL 212.43□□□□□ -0.421e-12■■■■■ 240.6
SF3B1O75533 SLC9A8-202ENST00000417961 6309 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.621e-12■■■■■ 240.6
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 4558.7 ms