Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC22BO75396 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms