Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK1O75385 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK1O75385 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK1O75385 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK1O75385 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK1O75385 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK1O75385 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK1O75385 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK1O75385 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK1O75385 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ULK1O75385 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ULK1O75385 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ULK1O75385 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ULK1O75385 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ULK1O75385 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ULK1O75385 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ULK1O75385 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ULK1O75385 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ULK1O75385 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ULK1O75385 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK1O75385 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK1O75385 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK1O75385 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK1O75385 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK1O75385 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK1O75385 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK1O75385 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK1O75385 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK1O75385 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ULK1O75385 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ULK1O75385 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ULK1O75385 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ULK1O75385 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ULK1O75385 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ULK1O75385 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ULK1O75385 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ULK1O75385 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ULK1O75385 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ULK1O75385 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ULK1O75385 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ULK1O75385 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ULK1O75385 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ULK1O75385 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ULK1O75385 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ULK1O75385 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ULK1O75385 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ULK1O75385 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ULK1O75385 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ULK1O75385 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK1O75385 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK1O75385 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK1O75385 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK1O75385 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK1O75385 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK1O75385 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ULK1O75385 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ULK1O75385 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ULK1O75385 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ULK1O75385 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ULK1O75385 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ULK1O75385 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK1O75385 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK1O75385 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK1O75385 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK1O75385 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK1O75385 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK1O75385 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK1O75385 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK1O75385 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK1O75385 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK1O75385 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ULK1O75385 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ULK1O75385 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ULK1O75385 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ULK1O75385 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ULK1O75385 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ULK1O75385 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ULK1O75385 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ULK1O75385 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ULK1O75385 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ULK1O75385 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ULK1O75385 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ULK1O75385 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK1O75385 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK1O75385 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK1O75385 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK1O75385 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK1O75385 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK1O75385 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK1O75385 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK1O75385 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK1O75385 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK1O75385 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK1O75385 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK1O75385 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK1O75385 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK1O75385 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ULK1O75385 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ULK1O75385 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ULK1O75385 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms