Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPFIA4O75335 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIA4O75335 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA4O75335 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA4O75335 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA4O75335 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA4O75335 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA4O75335 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA4O75335 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA4O75335 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA4O75335 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPFIA4O75335 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPFIA4O75335 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PPFIA4O75335 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPFIA4O75335 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPFIA4O75335 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA4O75335 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA4O75335 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA4O75335 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA4O75335 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA4O75335 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA4O75335 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA4O75335 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA4O75335 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA4O75335 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA4O75335 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA4O75335 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA4O75335 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA4O75335 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA4O75335 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA4O75335 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA4O75335 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA4O75335 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA4O75335 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA4O75335 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA4O75335 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms