Protein–RNA interactions for Protein: O75064

DENND4B, DENN domain-containing protein 4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4BO75064 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
DENND4BO75064 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
DENND4BO75064 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
DENND4BO75064 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
DENND4BO75064 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
DENND4BO75064 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
DENND4BO75064 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
DENND4BO75064 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
DENND4BO75064 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
DENND4BO75064 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
DENND4BO75064 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
DENND4BO75064 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
DENND4BO75064 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
DENND4BO75064 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
DENND4BO75064 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
DENND4BO75064 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
DENND4BO75064 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
DENND4BO75064 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
DENND4BO75064 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
DENND4BO75064 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
DENND4BO75064 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
DENND4BO75064 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
DENND4BO75064 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
DENND4BO75064 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
DENND4BO75064 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
DENND4BO75064 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
DENND4BO75064 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
DENND4BO75064 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
DENND4BO75064 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
DENND4BO75064 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
DENND4BO75064 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
DENND4BO75064 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
DENND4BO75064 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
DENND4BO75064 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
DENND4BO75064 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
DENND4BO75064 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
DENND4BO75064 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
DENND4BO75064 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
DENND4BO75064 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
DENND4BO75064 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
DENND4BO75064 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
DENND4BO75064 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.84■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
DENND4BO75064 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
DENND4BO75064 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms