Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20BO75063 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20BO75063 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM20BO75063 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20BO75063 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20BO75063 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20BO75063 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20BO75063 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20BO75063 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20BO75063 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20BO75063 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20BO75063 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20BO75063 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20BO75063 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20BO75063 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20BO75063 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms