Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP2O75044 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2O75044 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP2O75044 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms