Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRAMEF2O60811 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF2O60811 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms