Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOBOXO60393 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOBOXO60393 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms