Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PEX1O43933 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX1O43933 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX1O43933 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX1O43933 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX1O43933 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX1O43933 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX1O43933 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX1O43933 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX1O43933 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX1O43933 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX1O43933 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX1O43933 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX1O43933 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX1O43933 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX1O43933 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX1O43933 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX1O43933 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX1O43933 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX1O43933 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX1O43933 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX1O43933 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX1O43933 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX1O43933 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX1O43933 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX1O43933 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX1O43933 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX1O43933 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX1O43933 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX1O43933 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX1O43933 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX1O43933 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX1O43933 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX1O43933 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX1O43933 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX1O43933 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEX1O43933 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX1O43933 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX1O43933 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX1O43933 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX1O43933 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX1O43933 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX1O43933 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX1O43933 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX1O43933 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX1O43933 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX1O43933 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX1O43933 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX1O43933 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX1O43933 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX1O43933 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX1O43933 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX1O43933 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX1O43933 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX1O43933 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX1O43933 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX1O43933 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX1O43933 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX1O43933 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX1O43933 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PEX1O43933 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX1O43933 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX1O43933 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX1O43933 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX1O43933 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX1O43933 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX1O43933 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX1O43933 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX1O43933 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX1O43933 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX1O43933 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX1O43933 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX1O43933 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX1O43933 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX1O43933 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX1O43933 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX1O43933 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX1O43933 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX1O43933 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX1O43933 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX1O43933 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX1O43933 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX1O43933 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX1O43933 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX1O43933 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX1O43933 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX1O43933 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX1O43933 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX1O43933 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX1O43933 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX1O43933 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX1O43933 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX1O43933 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX1O43933 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX1O43933 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX1O43933 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX1O43933 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX1O43933 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX1O43933 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX1O43933 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms