Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRNO43815 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRNO43815 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRNO43815 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRNO43815 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRNO43815 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRNO43815 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRNO43815 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRNO43815 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRNO43815 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRNO43815 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRNO43815 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRNO43815 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRNO43815 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRNO43815 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRNO43815 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
STRNO43815 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRNO43815 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRNO43815 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRNO43815 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRNO43815 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRNO43815 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRNO43815 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRNO43815 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRNO43815 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRNO43815 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRNO43815 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRNO43815 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRNO43815 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRNO43815 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRNO43815 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRNO43815 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRNO43815 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRNO43815 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRNO43815 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRNO43815 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRNO43815 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRNO43815 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRNO43815 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRNO43815 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRNO43815 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRNO43815 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRNO43815 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRNO43815 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
STRNO43815 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRNO43815 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRNO43815 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRNO43815 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRNO43815 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRNO43815 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRNO43815 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRNO43815 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRNO43815 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRNO43815 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRNO43815 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRNO43815 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRNO43815 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRNO43815 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRNO43815 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRNO43815 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
STRNO43815 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
STRNO43815 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRNO43815 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRNO43815 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRNO43815 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRNO43815 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRNO43815 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STRNO43815 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STRNO43815 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRNO43815 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRNO43815 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRNO43815 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRNO43815 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRNO43815 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRNO43815 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRNO43815 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRNO43815 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRNO43815 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRNO43815 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRNO43815 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRNO43815 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRNO43815 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STRNO43815 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STRNO43815 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRNO43815 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRNO43815 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRNO43815 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRNO43815 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRNO43815 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRNO43815 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRNO43815 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRNO43815 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRNO43815 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRNO43815 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
STRNO43815 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRNO43815 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRNO43815 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRNO43815 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRNO43815 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRNO43815 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms