Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNGR3O43761 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR3O43761 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms