Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERI3O43414 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERI3O43414 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERI3O43414 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERI3O43414 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERI3O43414 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERI3O43414 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERI3O43414 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERI3O43414 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERI3O43414 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERI3O43414 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERI3O43414 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERI3O43414 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERI3O43414 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERI3O43414 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERI3O43414 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERI3O43414 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERI3O43414 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERI3O43414 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERI3O43414 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERI3O43414 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERI3O43414 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERI3O43414 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERI3O43414 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERI3O43414 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERI3O43414 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERI3O43414 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERI3O43414 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERI3O43414 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERI3O43414 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERI3O43414 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERI3O43414 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERI3O43414 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERI3O43414 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERI3O43414 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERI3O43414 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERI3O43414 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERI3O43414 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERI3O43414 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERI3O43414 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERI3O43414 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERI3O43414 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERI3O43414 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERI3O43414 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERI3O43414 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERI3O43414 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERI3O43414 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERI3O43414 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERI3O43414 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERI3O43414 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERI3O43414 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERI3O43414 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERI3O43414 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERI3O43414 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERI3O43414 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERI3O43414 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERI3O43414 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERI3O43414 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERI3O43414 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERI3O43414 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERI3O43414 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERI3O43414 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERI3O43414 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERI3O43414 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERI3O43414 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERI3O43414 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERI3O43414 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERI3O43414 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERI3O43414 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERI3O43414 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERI3O43414 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERI3O43414 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERI3O43414 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERI3O43414 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERI3O43414 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERI3O43414 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERI3O43414 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERI3O43414 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERI3O43414 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERI3O43414 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERI3O43414 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERI3O43414 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERI3O43414 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERI3O43414 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERI3O43414 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERI3O43414 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERI3O43414 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERI3O43414 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERI3O43414 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERI3O43414 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERI3O43414 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERI3O43414 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERI3O43414 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERI3O43414 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERI3O43414 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERI3O43414 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERI3O43414 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERI3O43414 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERI3O43414 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERI3O43414 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms