Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK2O43353 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK2O43353 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms