Protein–RNA interactions for Protein: O43323

DHH, Desert hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHHO43323 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHHO43323 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHHO43323 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHHO43323 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DHHO43323 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DHHO43323 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DHHO43323 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DHHO43323 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHHO43323 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHHO43323 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHHO43323 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHHO43323 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHHO43323 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHHO43323 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHHO43323 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHHO43323 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHHO43323 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHHO43323 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHHO43323 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHHO43323 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHHO43323 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHHO43323 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHHO43323 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHHO43323 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHHO43323 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DHHO43323 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHHO43323 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DHHO43323 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHHO43323 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHHO43323 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHHO43323 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHHO43323 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHHO43323 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DHHO43323 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DHHO43323 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHHO43323 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHHO43323 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHHO43323 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHHO43323 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DHHO43323 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DHHO43323 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DHHO43323 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHHO43323 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHHO43323 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHHO43323 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHHO43323 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHHO43323 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DHHO43323 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHHO43323 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHHO43323 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHHO43323 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHHO43323 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHHO43323 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHHO43323 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHHO43323 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHHO43323 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHHO43323 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHHO43323 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHHO43323 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHHO43323 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHHO43323 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHHO43323 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHHO43323 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHHO43323 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHHO43323 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHHO43323 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHHO43323 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHHO43323 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHHO43323 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHHO43323 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHHO43323 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHHO43323 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHHO43323 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHHO43323 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHHO43323 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHHO43323 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHHO43323 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DHHO43323 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHHO43323 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHHO43323 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHHO43323 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHHO43323 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHHO43323 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHHO43323 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHHO43323 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHHO43323 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHHO43323 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHHO43323 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DHHO43323 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DHHO43323 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DHHO43323 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DHHO43323 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHHO43323 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHHO43323 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHHO43323 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHHO43323 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DHHO43323 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHHO43323 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHHO43323 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHHO43323 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms