Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC7A4O43246 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC7A4O43246 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms