Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHGDHO43175 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHGDHO43175 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.1 ms