Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLOCKO15516 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLOCKO15516 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms