Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUPL2O15504 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUPL2O15504 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms