Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
LAMA5O15230 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA5O15230 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms