Protein–RNA interactions for Protein: O15027

SEC16A, Protein transport protein Sec16A, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16AO15027 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC16AO15027 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC16AO15027 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms