Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASKO14936 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKO14936 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKO14936 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKO14936 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKO14936 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKO14936 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKO14936 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKO14936 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKO14936 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKO14936 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKO14936 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKO14936 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKO14936 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKO14936 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASKO14936 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CASKO14936 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASKO14936 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASKO14936 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASKO14936 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASKO14936 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASKO14936 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASKO14936 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKO14936 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKO14936 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKO14936 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKO14936 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKO14936 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKO14936 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKO14936 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKO14936 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKO14936 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASKO14936 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASKO14936 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASKO14936 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASKO14936 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASKO14936 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASKO14936 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASKO14936 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKO14936 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKO14936 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKO14936 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKO14936 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKO14936 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKO14936 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKO14936 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASKO14936 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASKO14936 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASKO14936 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASKO14936 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASKO14936 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKO14936 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKO14936 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKO14936 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKO14936 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKO14936 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKO14936 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKO14936 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKO14936 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKO14936 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKO14936 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKO14936 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKO14936 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKO14936 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKO14936 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKO14936 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKO14936 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKO14936 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKO14936 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKO14936 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKO14936 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKO14936 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKO14936 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKO14936 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKO14936 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKO14936 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKO14936 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKO14936 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKO14936 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKO14936 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKO14936 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKO14936 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKO14936 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKO14936 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKO14936 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKO14936 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKO14936 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKO14936 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKO14936 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKO14936 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKO14936 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKO14936 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKO14936 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKO14936 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKO14936 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKO14936 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKO14936 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASKO14936 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASKO14936 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASKO14936 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms