Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LIN7AO14910 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms