Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR6O00574 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR6O00574 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCR6O00574 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR6O00574 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms