Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DFFAO00273 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DFFAO00273 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DFFAO00273 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DFFAO00273 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DFFAO00273 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DFFAO00273 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DFFAO00273 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DFFAO00273 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DFFAO00273 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DFFAO00273 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DFFAO00273 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DFFAO00273 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DFFAO00273 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DFFAO00273 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DFFAO00273 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DFFAO00273 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DFFAO00273 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DFFAO00273 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DFFAO00273 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DFFAO00273 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DFFAO00273 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DFFAO00273 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DFFAO00273 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DFFAO00273 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DFFAO00273 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DFFAO00273 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DFFAO00273 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DFFAO00273 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DFFAO00273 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DFFAO00273 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DFFAO00273 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DFFAO00273 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DFFAO00273 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DFFAO00273 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DFFAO00273 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DFFAO00273 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DFFAO00273 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DFFAO00273 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DFFAO00273 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DFFAO00273 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DFFAO00273 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DFFAO00273 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DFFAO00273 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DFFAO00273 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DFFAO00273 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DFFAO00273 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DFFAO00273 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DFFAO00273 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DFFAO00273 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DFFAO00273 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DFFAO00273 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DFFAO00273 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DFFAO00273 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DFFAO00273 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DFFAO00273 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DFFAO00273 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DFFAO00273 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DFFAO00273 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DFFAO00273 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DFFAO00273 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DFFAO00273 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DFFAO00273 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DFFAO00273 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DFFAO00273 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DFFAO00273 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DFFAO00273 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DFFAO00273 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DFFAO00273 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DFFAO00273 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DFFAO00273 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DFFAO00273 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DFFAO00273 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DFFAO00273 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DFFAO00273 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DFFAO00273 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DFFAO00273 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DFFAO00273 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DFFAO00273 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DFFAO00273 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DFFAO00273 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DFFAO00273 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DFFAO00273 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DFFAO00273 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DFFAO00273 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DFFAO00273 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DFFAO00273 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DFFAO00273 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DFFAO00273 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DFFAO00273 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DFFAO00273 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DFFAO00273 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DFFAO00273 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DFFAO00273 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DFFAO00273 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DFFAO00273 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DFFAO00273 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DFFAO00273 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DFFAO00273 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DFFAO00273 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms