Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX39AO00148 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX39AO00148 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX39AO00148 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX39AO00148 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX39AO00148 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX39AO00148 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DDX39AO00148 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX39AO00148 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX39AO00148 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX39AO00148 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX39AO00148 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX39AO00148 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DDX39AO00148 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX39AO00148 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX39AO00148 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX39AO00148 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX39AO00148 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX39AO00148 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX39AO00148 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms