Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA8SH3BPF8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA8SH3BPF8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA8SH3BPF8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms