Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BNH8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BNH8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BNH8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BNH8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BNH8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BNH8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BNH8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BNH8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BNH8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BNH8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BNH8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BNH8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BNH8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BNH8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BNH8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BNH8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BNH8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BNH8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BNH8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNH8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BNH8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BNH8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BNH8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BNH8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BNH8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BNH8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BNH8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BNH8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BNH8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BNH8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BNH8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BNH8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BNH8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BNH8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BNH8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BNH8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BNH8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BNH8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BNH8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BNH8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BNH8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BNH8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BNH8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BNH8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BNH8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BNH8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BNH8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BNH8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BNH8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BNH8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BNH8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BNH8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BNH8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BNH8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BNH8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BNH8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BNH8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BNH8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BNH8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BNH8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BNH8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BNH8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BNH8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BNH8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BNH8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BNH8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BNH8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BNH8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BNH8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BNH8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BNH8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BNH8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BNH8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BNH8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
H3BNH8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H3BNH8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H3BNH8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H3BNH8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BNH8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BNH8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BNH8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms