Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms