Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPB6E9PJ23 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB6E9PJ23 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms