Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms