Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF839A8K0R7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF839A8K0R7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF839A8K0R7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF839A8K0R7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF839A8K0R7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF839A8K0R7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF839A8K0R7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF839A8K0R7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF839A8K0R7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF839A8K0R7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF839A8K0R7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF839A8K0R7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF839A8K0R7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF839A8K0R7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF839A8K0R7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF839A8K0R7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF839A8K0R7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms