Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP27XA6NNY8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP27XA6NNY8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP27XA6NNY8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP27XA6NNY8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP27XA6NNY8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP27XA6NNY8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP27XA6NNY8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP27XA6NNY8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP27XA6NNY8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP27XA6NNY8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP27XA6NNY8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms