Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL13PA6NNM8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTLL13PA6NNM8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL13PA6NNM8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL13PA6NNM8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL13PA6NNM8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms