Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAC3D1A6NKF1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAC3D1A6NKF1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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