Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIPT2A6NK58 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIPT2A6NK58 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIPT2A6NK58 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIPT2A6NK58 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIPT2A6NK58 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIPT2A6NK58 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIPT2A6NK58 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIPT2A6NK58 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIPT2A6NK58 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIPT2A6NK58 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LIPT2A6NK58 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LIPT2A6NK58 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIPT2A6NK58 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIPT2A6NK58 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIPT2A6NK58 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIPT2A6NK58 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms