Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XIRP2A4UGR9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
XIRP2A4UGR9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms