Protein–RNA interactions for Protein: A0AV02

SLC12A8, Solute carrier family 12 member 8, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A8A0AV02 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SLC12A8A0AV02 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC12A8A0AV02 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC12A8A0AV02 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms