Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV27A0A087WT01 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms