Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms