Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBNO2Q9Y2G9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO2Q9Y2G9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms