Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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