Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms