Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA3Q9UL41 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms