Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms