Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIKQ9UKE5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms