Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms